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我国在水稻基因组合功能基因组的研究和杂交水稻遗传改良上处于国际先进水平。如果将我国杂交稻研究优势与生物技术有机结合，完全有可能使我国的优质杂交稻研究处于世界领先地位。为此，我们应该着重加强以下三个方面的研究：
筛选水稻优质核心种质
优良种质是选育优良品种的源泉和基础。我国长期入库的水稻种质资源有近72000份，这些丰富的基因资源是我国稻作科学持续发展的基础与巨大潜在优势。但是这些种质的筛选是基于应用DNA水平的遗传多样性评价和重要农艺性状形态描述，缺乏品质性状的精确分析以及品质性状与DNA水平的遗传多样性之间的关系的相关统计，难以直接用于优质品种（系）的选育。因此，必须加强我国优质水稻核心种质资源的鉴定与筛选，尤其是那些类似美国野稻的稀有地方珍贵品种资源。
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