其实微波加热的原理很简单，乃是利用微波(即所谓的电磁波)引发鲜奶内部水分子的剧烈震荡，水分子间因为震荡而彼此摩擦产生高温(热)，而使鲜奶升温。所以从其加热方式的理论而言，并不会对人体造成所谓致癌性的伤害。
　　
　　另外，鲜奶即使加热过，影响的只是本身奶蛋白会因为受热而稍稍产生凝结的现象(为蛋白质加热后的凝聚现象，是自然的现象)。通常，要达到蛋白质的凝聚现象要高温加热一阵子，像如果我们以传统的方式用锅子煮牛奶，就会发现加热一段时间后，牛奶表面结了一层奶皮(就像豆浆会煮出豆皮的道理一样)，即使如此，这层奶皮还是可以安全食用的，在体内的消化吸收效果也一样好，所以牛奶用微波加热应可安全饮用无虞。